Les arbres flexibles sont souvent utilisés dans l’industrie aéronautique. Ils transmettent un mouvement de rotation comme un arbre rigide, mais peuvent être mis en place de façon à contourner des obstacles, dans des configurations où un arbre rigide ne serait pas adapté. Ils peuvent être utilisés pour des commandes d’inverseurs de poussée, des commandes de volets ou de vannes, des commandes de portes cargo …
Une application particulièrement pertinente est une commande de secours permettant de suppléer à une éventuelle panne de commande de vannes automatiques ; les vannes peuvent alors être manipulées manuellement.